生物工程主要研究现代生物工程技术及其产业化的原理、工艺过程和工程设计等方面的基本知识和技能，在制药、农林、食品等领域进行产品研发、生产、质量检测等。本专业课程体系有《发酵工程》、《生化工程》、《细胞工程》、《基因工程》、《普通微生物学》、《动物学基础》、《生物信息学》、《生物技术制药》、《生物分离工程》、《蛋白质工程》。
部分高校按食用菌、发酵工程、生物农药、生物质能源、微生物应用、农业生物技术、食品发酵与生物制剂方向培养。
该专业学生毕业可在医药类企业从事生物工程、产品研发、生物制药、技术开发、工程设计、生产管理、药物检测，也可在农林类企业从事产品培育、植物组培、去病毒技术，还可以在食品类企业从事发酵工程、转基因技术。
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