1、跨平台性，虽然是很好的优势，可以让java在任何的系统中运行，但是前提是该系统要安装java虚拟机，这样导致一些java编写的桌面程序无法在一般的用户(没有安装java虚拟机的用户)上使用。
2、java的身后是sun公司，提供及时的api更新，但是过多的版本导致java的向下兼容性很差。而sun公司在j2ee上的标准定义的并不是完美，导致在j2ee的开发中多数使用开源框架，开源框架是好东西，但是更新速度并不快。
3、都说面向对象的语言先进与面向过程，java是oop语言，但是它适合的是bs系统，在web项目中java的实力毋庸置疑，但是转到了底层的程序却无法同c++抗衡。
4、个人认为java的最大优点是开源，但是这往往也成了最大的缺陷了，无法定义一个好的标准使得开发时使用了框架，在新的程序员来到公司时必须先了解框架，延缓了开发的时间。
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