药物化学专业的毕业生就业前景还是不错的，尤其是男生就业比较乐观，在药学领域，单从技术上考虑，药物化学是最有前途的，薪资也比较高。
该专业的毕业生就业方向为各类药物研究单位，有机化学研究所、医药生产企业和药政机构等单位，也可从事高等学校的教学工作。
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