免费婚检有效期是三个月，自领取婚检单之日起计算。男女双方在结婚登记时，应当持有婚前医学检查证明或医学鉴定证明。办理结婚登记的当事人经婚检，发现患有医学上认为不应当结婚的疾病的，婚姻登记机关不予登记。
《《婚姻登记条例》》第六条
办理结婚登记的当事人有下列情形之一的，婚姻登记机关不予登记：
(一)未到法定结婚年龄的；
(二)非双方自愿的；
(三)一方或者双方已有配偶的；
(四)属于直系血亲或者三代以内旁系血亲的；
(五)患有医学上认为不应当结婚的疾病的。
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