中国科学技术大学王牌特色专业有信息安全、软件工程、数学类、物理学、电子信息工程、化学、生物科学、地球物理学、计算机科学与技术，完整王牌特色专业见下表：
| 中国科学技术大学比较好的王牌重点特色专业一览表 | ||||
| 序号 | 专业名称 | 重点类型 | 专业大类 | 专业类型 | 1 | 信息安全 | 国家级特色专业 | 计算机类 | 本科 | 2 | 软件工程 | 国家级特色专业 | 计算机类 | 本科 | 3 | 数学类 | 国家级特色专业 | 数学类 | 本科 | 4 | 物理学 | 国家级特色专业 | 物理学类 | 本科 | 5 | 电子信息工程 | 国家级特色专业 | 电子信息类 | 本科 | 6 | 化学 | 国家级特色专业 | 化学类 | 本科 | 7 | 生物科学 | 国家级特色专业 | 生物科学类 | 本科 | 8 | 地球物理学 | 国家级特色专业 | 地球物理学类 | 本科 | 9 | 计算机科学与技术 | 国家级特色专业 | 计算机类 | 本科 |
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| 中国科学技术大学开设专业一览表 | |||
| 序号 | 专业名称 | 专业大类 | 专业类型 | 1 | 信息安全 | 计算机类 | 本科 | 2 | 软件工程 | 计算机类 | 本科 | 3 | 数学类 | 数学类 | 本科 | 4 | 物理学 | 物理学类 | 本科 | 5 | 电子信息工程 | 电子信息类 | 本科 | 6 | 化学 | 化学类 | 本科 | 7 | 工商管理 | 工商管理类 | 本科 | 8 | 机械设计制造及其自动化 | 机械类 | 本科 | 9 | 能源与动力工程 | 能源动力类 | 本科 | 10 | 管理科学 | 管理科学与工程类 | 本科 | 11 | 环境科学 | 环境科学与工程类 | 本科 | 12 | 理论与应用力学 | 力学类 | 本科 | 13 | 英语 | 外国语言文学类 | 本科 | 14 | 生物科学 | 生物科学类 | 本科 | 15 | 地球物理学 | 地球物理学类 | 本科 | 16 | 核工程与核技术 | 核工程类 | 本科 | 17 | 计算机科学与技术 | 计算机类 | 本科 | 18 | 传播学 | 新闻传播学类 | 本科 | 19 | 材料化学 | 材料类 | 本科 | 20 | 安全工程 | 安全科学与工程类 | 本科 | 21 | 地球化学 | 地质学类 | 本科 | 22 | 通信工程 | 电子信息类 | 本科 | 23 | 统计学 | 统计学类 | 本科 | 24 | 自动化 | 自动化类 | 本科 | 25 | 生物技术 | 生物科学类 | 本科 | 26 | 数学与应用数学 | 数学类 | 本科 | 27 | 天文学 | 天文学类 | 本科 | 28 | 信息与计算科学 | 数学类 | 本科 | 29 | 应用物理学 | 物理学类 | 本科 | 30 | 光电信息科学与工程 | 电子信息类 | 本科 | 31 | 材料物理 | 材料类 | 本科 | 32 | 高分子材料与工程 | 材料类 | 本科 | 33 | 测控技术与仪器 | 仪器类 | 本科 | 34 | 电子科学与技术 | 电子信息类 | 本科 | 35 | 大气科学 | 大气科学类 | 本科 | 36 | 信息管理与信息系统 | 管理科学与工程类 | 本科 | 37 | 金融学 | 金融学类 | 本科 | 38 | 考古学 | 历史学类 | 本科 |
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