武汉科技大学（以下简称武科大）自动化专业保研可以申请的学校主要包括以下几所：
1. 中国科学技术大学
2. 清华大学
3. 北京航空航天大学
4. 哈尔滨工业大学
5. 复旦大学
6. 上海交通大学
7. 华中科技大学
8. 中山大学
9. 厦门大学
10. 浙江大学
11. 南京大学
12. 同济大学
13. 西安交通大学
以上是常见的一些武科大自动化专业保研可申请的学校，具体情况可能会根据不同年份的政策和录取情况有所变化，建议及时查看相关官方通知和资料。同时，在考虑保研时，也要根据自身的实际情况进行合理选择，并做好准备和规划。
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