大连海事大学设有多个学科门类和教学科研机构，具体科系设置如下：
涵盖哲学、经济学、法学、文学、理学、工学、管理学、交叉学科等8大门类。
航海学院
航海技术（含航海仪器、船舶安全管理等方向）
轮机工程（含轮机自动化、船舶污染控制）
地理信息系统（GIS）
安全工程
船舶与海洋工程学院
船舶与海洋工程、轮机工程、海洋资源与环境等
船舶电子电气工程、自动化类
交通运输工程学院
交通运输、交通管理、物流工程、航运管理
公共事业管理、能源与动力工程
经济管理类
财务管理、会计、市场营销、物流管理
国际经济与贸易、工商管理
法学类
海商法、国际经济法、知识产权法
理学与工学
数学与应用数学、应用物理学、机械设计制造
船舶与海洋工程、轮机工程进入ESI全球前1‰
管理科学与工程
供应链管理、项目管理、物流系统规划
外国语类
英语、日语、俄语等
公共管理与人文学科
行政管理、公共事业管理、法学（国际经济法）
国家级重点学科 ：交通运输工程、船舶与海洋工程、法学
ESI全球排名 ：工程学进入前1‰，多个学科进入前1%
国际认可度 ：被国际海事组织认证为“享有国际盛誉”的海事院校
学校以航海类专业为核心，形成了工、管、经、法、文、理等多学科协调发展的体系，80%专业直接服务于海事产业链，培养了数以万计的航运及管理人才。
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